1、单纯疱疹病毒性脑炎需要与：带状疱疹病毒性脑炎、肠道病毒性脑炎、巨细胞病毒性脑炎、急性播散性脑脊髓炎相鉴别。
2、病毒性脑炎需要与细菌性脑炎相鉴别：病毒性脑炎的症状较轻，脑脊液白细胞数量约10~1000×106/L，脑脊液以淋巴细胞为主，脑脊液的含糖量正常。而细菌性脑炎症状较重，脑脊液白细胞数≥1000×106/L，成分以中性粒细胞为主，含糖量明显降低。
