与垂体机能减退相关的几种激素缺乏症可能导致继发性疾病。例如，生长激素缺乏症与肥胖，胆固醇升高和代谢综合征有关，而雌二醇缺乏症可能导致骨质疏松症。有效治疗潜在的激素缺乏症可能会改善这些风险，但通常有必要直接对其进行治疗。

女性缺乏LH和FSH，常并发闭经，第二性征退化，不育。阉割或更年期女性症状就是无性腺状态的典型表现。男性缺乏促性腺激素，常并发阳痿，睾丸萎缩，第二性征退化和精子生成减少伴不育。