在门诊或麻醉下通过检查进行诊断（称为EUA或在麻醉下检查）。瘘管可以使用瘘管探针（狭窄的仪器）进行探查。这样，有可能找到两个开口。该检查可以是肛门镜检查。进行瘘管造影，直肠镜检查和/或乙状结肠镜检查可以辅助诊断。可能的发现：
·可以观察到瘘管在皮肤上的开放
·该区域可能在检查时很痛苦
·可能会发红的面积硬结可能会感觉到; 由于慢性感染而增厚
·可能会看到放电
·可能出现感染的肛周“孔”或开口的其他情况包括绒毛状囊肿。