癫痫的诊断可能很困难。许多其他情况可能会表现出与癫痫发作非常相似的体征和症状，包括晕厥，过度换气，偏头痛，发作性睡病，惊恐发作和精神性非癫痫性癫痫发作（PNES）。特别是晕厥可伴有短暂的抽搐。夜间额叶癫痫常被误诊为噩梦，被认为是一种失眠症，但后来被确定为癫痫综合症。运动障碍的发作阵发性运动障碍可用于癫痫发作。跌落攻击的原因可能是无力性癫痫发作。

儿童可能有容易被误认为是癫痫发作的行为，而事实并非如此。这些措施包括屏气，湿床，夜间恐怖，抽动和颤抖发作。胃食管反流可能导致婴儿背部弯曲和头部向侧面扭曲，这可能被误认为是强直阵挛性癫痫发作。

误诊很常见（约占5％到30％的情况）。不同的研究表明，在许多情况下，在明显具有治疗抵抗力的癫痫发作中发作样发作均是心血管原因。在癫痫病门诊看病的人中约有20％患有PNES，而在PNES中约有10％的人也有癫痫病。仅根据癫痫发作将两者分开而不进行进一步测试通常很困难。