注意与宫内感染，中枢神经畸形，颅内出血等疾病鉴别。
1、新生儿颅内出血CT检查可证实为颅内出血，可明确显示出血的类型，位置，形态，大小范围，出血量和对周围脑组织的压迫情况;而HIE病理变化包括脑水肿，脑组织坏死和颅内出血，这些病理改变可由临床表现及CT扫描证实。
2、头颅的先天畸形和病毒感染若缺氧缺血发生在出生前几周或几个月时，患儿在出生时可无窒息，也无神经系统症状，但在数天或数周后出现亚急性或慢性脑病的表现，临床上较难与先天性脑畸形或宫内病毒感染相区别，CT检查可反映头颅的先天畸形，病原学和血清特异抗体检查有利于病毒感染性疾病的鉴别。
