卫生管理
卫生管理是预防戊型肝炎最重要的措施。这包括对人类废物的适当处理和处置，更高的公共供水标准，改进的个人卫生程序以及卫生食品的准备。因此，这种疾病的预防策略与困扰发展中国家的许多其他疾病的策略相似。在71°C（159.8°F）的温度下烹饪五分钟会杀死戊型肝炎病毒，不同的温度意味着将病毒灭活的时间也不同。
血液制品
血液产品中引起跨功能传播感染（TTI）所需的病毒数量似乎是可变的。戊型肝炎病毒的输血传播可以通过minipool HEV NAT（核酸检测）筛选进行筛选。NAT是一种在接受献血时用于分子筛查血液的技术。它会筛选TTI。
疫苗
一种基于重组病毒蛋白的疫苗是在1990年代开发的，并于2001年在高危人群中（尼泊尔）进行了测试。该疫苗似乎是有效和安全的，但是由于缺乏盈利能力而停止了研发，因为肝炎E在发达国家很少见。没有在美国许可使用戊型肝炎疫苗。
尽管其他HEV疫苗试验已经成功，但这些疫苗尚未生产或普遍提供给易感人群。例外是中国；经过中国国家食品药品监督管理局（SFDA）一年多的审查和检查，由中国科学家开发的戊型肝炎疫苗已于2012年底面市。该疫苗（由其开发商厦门创新生物技术开发，称为HEV 239）在对江苏省 100,000多人进行了一项对照试验后，中国科学技术部于2012年批准了预防戊型肝炎的措施在12个月内，没有任何疫苗接种者被感染，而安慰剂组为15例。第一批疫苗于2012年10月下旬从Innovax的工厂生产出来，出售给中国分销商。
由于缺乏证据，截至2015年，世界卫生组织未就常规使用HEV 239疫苗提出建议。其2015年立场是，国家主管部门可根据当地流行病学决定使用该疫苗。
