尿路结核很容易被忽视。许多患者表现出典型的“常规”细菌性膀胱炎典型的较低尿道症状，只有在对常规抗菌剂无反应或在常规培养基中无阳性培养物的尿液检查发现脓尿时，才引起对肺结核的怀疑。有时还会出现的其他症状包括腰背，胁腹和耻骨上疼痛、血尿、尿频，和夜尿，这些也可能提示常规细菌性尿路感染。肾绞痛很少见，仅占不到10％的患者，发烧，体重减轻和盗汗等体质症状也很罕见。只有三分之一的患者的X线胸片异常。

泌尿生殖道结核是结核分枝杆菌常见的肺外感染部位。通常，病变（结核性肉芽肿）始于肾脏，并向远端扩散至输尿管、膀胱和睾丸。

早期肉芽肿性肾病可表现为蛋白尿、肾尿和肾功能丧失。孤立性血尿是肾结核的另一种可能表现。

每当疾病扩散到输尿管和膀胱时，就会出现下尿路症状。提示尿路感染的泌尿系统症状，伴有脓尿和血尿，无细菌生长，提示泌尿生殖道结核。

晚期疾病可能导致梗阻性尿路病、膀胱缺陷和肾功能丧失。超声、计算机断层扫描和核磁共振将显示输尿管严重扭曲，狭窄和扩张区域交替，膀胱容积减少，肾积水，晚期肾脏减小。静脉尿路造影可显示结节变形或空洞，提示盆腔结核病变和右肾功能丧失。