展开 结核病的诊断通常是通过分离尿液样本中的病原体或组织活检来进行的。Ziehl-Neelsen染色可在离心尿液中看到耐酸杆菌。当只看到很少的杆菌时，应引起注意，因为它可能是环境非致病性分枝杆菌属细菌污染尿液的结果，这可能导致假阳性结果。

尿液分析

可能从轻度变化（例如蛋白尿和白细胞减少症）到极端的脓尿（有时伴有血尿）而有所不同。尿培养通常是阴性的，除非有严重的膀胱功能障碍。然而，通过使用Lowenstein-Jensen固体培养基来检测分枝杆菌的尿培养可能是有用的。应该获得多次采样以提高测试灵敏度。分枝杆菌属培养和鉴定结果可提供特定的诊断，但可能需要2到3周或更长时间才能得到。最近已使用聚合酶链反应（PCR）技术，例如直接Gen-Probe MAD测试。这是可靠且快速的诊断测试。

特别推荐进行膀胱镜检查和活检，因为它可以可视化和取样膀胱病变，并且可能是最可靠的测试方法。镜下可见膀胱粘膜可见充血、水肿、结核结节及溃疡等以三角区及患例输尿管口附近为明显。晚期膀胱结核使整个膀胱充血、水肿、呈一片通红。
耐酸细菌培养
耐酸杆菌的显微镜检测灵敏度低。相反，培养病原体具有很高的敏感性，但要花费6-8周才能获得结果。这些特征限制了诊断和治疗。在对肾结核的调查中，应使用至少三种不同的样品进行尿液中抗酸杆菌的检测和尿液培养。尿液检查的某些特征提示诊断为肾结核，例如酸性pH值，白细胞增多症和/或血尿，与导致尿路感染的常见细菌的阴性尿培养有关。
诊断结核的分子生物学
如今，分子生物学技术已被用于更快地获得结果，并且具有更高的灵敏度，以检测结核分枝杆菌和其他分枝杆菌属。在怀疑有耐药性的情况下，这些技术还可以建立对抗菌药物敏感性的模式，这在结核病流行地区可能是一个问题。这些技术基于针对细菌基因组不同区域的PCR，例如插入序列6110，16S核糖体DNA和编码热休克蛋白65的基因。有几种可商购的检测结核分枝杆菌的方法生物材料复杂。这些方法包括基于PCR的Amplicor（罗氏，巴塞尔，瑞士），连接酶链反应（Abbott Systems，雅培公园，伊利诺伊州），转录介导的转录（Gen-Probe，圣地亚哥，加利福尼亚）和RAPID-BAP-MTB分析（台湾台南亚洲基因研究院）。这种区分对指导治疗和阐明流行病学问题很有用，但是，这些方法不能将结核分枝杆菌与其他结核分枝杆菌复杂物种区分开来。基于PCR然后用限制酶消化的方法（PCR-限制片段长度多态性）具有区分分枝杆菌种类的优势。一些研究表明，尽管尿液中含有抑制性物质，但PCR在检测病原体方面是灵敏而特异性的。用于检测尿液中结核分枝杆菌的聚合酶链反应的灵敏度范围从25％到93％不等，并且特异性很高（95-100％）。
X线检查

X线检查在确定肾结核的诊断，明确病变的部位、范围、程度及对侧肾脏情况等方面有决定性意义。

（平片显示右肾下极钙化；肾实质损伤）

B型超声检查
早期无异常发现。肾组织明显破坏时，多出现异常波型并伴有肾体积增大。结核性脓肾则在肾区出现液平段。