在影像学上，须同纤维肉瘤，溶骨型骨肉瘤，淋巴瘤，溶骨性骨转移瘤鉴别，在组织学上，须同纤维肉瘤(梭形细胞多，鲱骨样结构)，骨肉瘤(肿瘤性成骨)鉴别，在纤维肉瘤和骨肉瘤中见到的类似恶性纤维组织细胞瘤区域，须进一步研究，在恶性纤维组织细胞瘤的诊断不肯定或不明确的情况下，诊断必须基于充足而大量的组织学切片，此外，恶性纤维组织细胞瘤的组织学鉴别诊断还包括癌的骨转移，它们较长的细胞排列成模糊的板层状结构，而恶性纤维组织细胞瘤的细胞也可有上皮样外观，并可聚集为成组的小泡状。