鉴别诊断

需要排除的可能模仿胃肠炎的迹象和症状的其他潜在原因包括阑尾炎，肠扭转，炎症性肠病，尿路感染和糖尿病。胰腺功能不全，短肠综合征，Whipple's病，腹腔疾病和通便性滥用也应考虑在内。如果该人仅表现出呕吐或腹泻（而不是两者），则鉴别诊断可能会有些复杂。

在多达33％的病例中，阑尾炎可能伴有呕吐，腹痛和少量腹泻。与胃肠炎典型的大量腹泻相反。儿童的肺部或泌尿道感染也可能引起呕吐或腹泻。经典的糖尿病酮症酸中毒（DKA）表现为腹痛，恶心和呕吐，但无腹泻。一项研究发现，最初诊断为DKA的儿童中有17％患有肠胃炎。