大多数病例是由于与受感染者密切接触而获得的感染性有机体。

病毒性咽炎

这些病毒约占所有感染病例的40-80%，可能是许多不同类型病毒感染的特征。

·腺病毒是最常见的病毒病因。通常，颈部淋巴结肿大的程度是适度的，喉部虽然疼痛，但通常不会出现红色。

·引起流感的正粘病毒科有快速发作的高温、头痛和全身疼痛。喉咙痛可能与此有关。

·传染性单核细胞增多症（“腺热”）是由爱泼斯坦-巴尔病毒引起的。这可能导致显著的淋巴结肿大和渗出性扁桃体炎，伴有明显的红肿和咽喉肿大。如果怀疑这一点，可以使用嗜异性试验。

·单纯疱疹病毒可引起多发性口腔溃疡。

·麻疹

·普通感冒：鼻病毒、冠状病毒、呼吸道合胞病毒和副流感病毒可引起咽喉、耳朵和肺部感染，引起标准的感冒样症状，并经常引起疼痛。

细菌

许多不同的细菌可以感染人类的喉咙。最常见的是A组链球菌（化脓性链球菌），但其他包括肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、百日咳杆菌、炭疽杆菌、白喉棒状杆菌、淋病奈瑟菌、肺炎衣原体、肺炎支原体和坏死梭杆菌。

链球菌性咽炎

链球菌性咽炎或链球菌性咽喉炎是由a组β-溶血性链球菌（GAS）引起的。它是咽炎最常见的细菌病因（15-30%）。常见症状包括发烧、喉咙痛和大淋巴结。它是一种传染病，通过与受感染者的密切接触传播。根据喉部培养结果作出明确诊断。抗生素有助于预防并发症（如风湿热）和加快康复。

坏死梭杆菌

坏死梭杆菌是口咽菌群的正常寄居菌，偶尔可造成扁桃体周围脓肿。在400个未经治疗的病例中，有一个发生了Lemierre综合征。

白喉

白喉是由白喉棒状杆菌引起的一种有潜在生命危险的上呼吸道感染，自儿童疫苗接种计划实施以来，在发达国家已基本根除，但在第三世界仍有报道，在东欧一些地区也越来越多。抗生素在早期是有效的，但恢复通常很慢

其他

少数其他原因是罕见的，但可能致命的，包括咽旁间隙感染：扁桃体周围脓肿（“昆西脓肿”），下颌下间隙感染（路德维希心绞痛）和会厌炎。

真菌

有些咽炎是由真菌感染引起的，如白色念珠菌，引起口疮。

非传染性

咽炎也可能由机械、化学或热刺激引起，例如冷空气或酸回流。有些药物可能会引起咽炎，如普拉克索和抗精神病药。