由于肘关节结核常表现为疼痛，局部肿胀，压痛，活动功能受限等，这些症状并非其特有表现，临床上还有许多疾病的临床表现与之相似，故需对这些疾病进行鉴别诊断，其中包括有以下几种疾病：  

1、化脓性骨髓炎病人有全身感染中毒反应病史，病变局部有化脓性炎症反应例如红，肿，热，痛，起病急骤，局部穿刺液细菌培养常为化脓性细菌。  

2、类风湿性关节炎该病为多发性，对称性关节发病，类风湿因子常为阳性，当鉴别有困难时，可行滑膜活检。  

3、化脓性脊椎炎。  

4、肿瘤。  

5、其它还包括骨质疏松症，神经性关节病等也须鉴别。