对于早泄的病因有很多争议，还不是很明确，传统观点认为早泄在很大程度上归因于心理性原因，主要以焦虑表现出来。如在性生活中受过挫折、对性生活没有信心、夫妻关系紧张等；对妻子存在负面情绪，致使应付心理的存在最后导致早泄的发生。性技巧的缺乏也可以导致早泄的发生。

目前普遍认为其发生是一个多因素的，其与心理因素、环境因素、内分泌因素以及神经生物学因素有关。

1、精神因素

这类早泄患者也可以称为心理性早泄，引发男性早泄的精神因素包括很多方面。

要注意的是，男性这种对性生活的紧张情绪会一直延续，并不会由于性生活环境的变化而马上产生变化，同时长期的性生活失败又会出现反作用，造成患者心理上的恶性循环。

2、器质性病变

很多男性疾病都会使男性的射精中枢兴奋度降低，也就是更容易发生射精，比如尿道炎、精囊炎、前列腺炎等炎症。

3、遗传因素

早泄有家族遗传倾向，并有相关研究证实这一假设。有研究表明，多巴胺转运蛋白基因（DAT-1）的串联重复与阴道内射精潜伏期调节具有关联性。具有较长串联重复基因的男性可以转录产生较多的转运蛋白，从而导致下游的突触多巴胺活性降低，这与早泄症状的产生具有相关性。

4、其他原因

男性阴茎包皮过长、紧身内裤等过度刺激龟头都会导致男性出现早泄。

近年来有研究显示，早泄患者阴茎背神经的兴奋性，尤其是阴茎头的感觉神经兴奋性比正常人高，性交时射精潜伏期与射精反射弧短，导致了射精刺激阈值低，最终引起过早的射精。

国内文献报道，原发性早泄患者不只是心理原因所致，最重要的事患者阴茎背神经兴奋性，尤其是阴茎头的感觉神经兴奋性比正常人高。还与炎症的刺激、包皮过长、包茎以及神经系统疾病有关。总之，早泄的发生是一个多因素联合作用的结果。