如果不进行治疗，大多数类型的疣可在几个月或几年内痊愈。

现在有很多方法去除疣。一份系统性临床文献回顾(clinical systemic review)指出，就各种药膏成分而言，水杨酸比安慰剂更有效。而以手术方法去处理，冷冻疗法是有效的。

需要注意的是，疣可以于成功移除后再复发。

药物

·咪喹莫特（Imiquimod）

可以帮助人体的免疫系统生产对抗疣病毒的干扰素。美国食品和药物管理局的生殖器疣（FDA）已正式批准了临床使用在性病疣。这种药物目前还是非常昂贵。

·鬼臼毒素(Warteccream)(podophyllotoxin0.15%)

是由植物鬼臼的根纯化萃取出的抗病毒物质，能有效抑制细胞中期的"有丝分裂"过程。用于治疗由人类乳头瘤病毒引起的尖锐湿疣。商品名分别为慷定来和化疣敌乳膏。鬼臼毒素有致畸胎的问题，不适合孕妇使用。

·水杨酸

很多标为“治疣涂液”的非处方产品都含有水杨酸，此类产品于药店和超市都可以容易购买到，但比皮肤科医生使用的处方产品浓度要低很多。这类产品通常以两种应用类型包装，可以是瓶装的水杨酸溶液，亦可能是含水杨酸的粘接垫片，直接贴到患处。虽然这类产品有效，但过程可能需要长达一年。

手术移除

物理性分离角质层，方法包括先杀死表面细胞（例如使用水杨酸或其他有毒物质），再用浮石，刀片机械性的削走表皮。医生亦会用手术刮来刮除(curettage)疣体　

电灼，即以高温电刀把疣组织水分挥发掉，令病灶死亡。

冷冻治疗。当细胞暴露于低温（如零下摄氏20度）的环境，细胞就会死亡，但细胞外组织(extra-cellularmatrix)不会受影响，所以当病灶随正常新陈代谢脱落后，表皮不会留下疤痕。

*传统方法为直接喷液态氮到病灶或以棉花棒点于液态氮中再接触病灶。这方法平均要作3至4次治疗才有效，较厚的皮肤，例如手掌或脚底，甚至需要施行十次以上的治疗方有效。可能是由于使用直接喷射法时，医生不能有效控制冷冻剂喷达的位置；使用间接接触法时，由于冷冻力不足够，当皮肤最外位置结冰后，冰令热传导大幅降低，病灶中心将未能够被有效冷冻，复发比率高。

*二甲醚或丙烷混合气作冷冻剂。冷冻剂喷到海绵涂布器上，再把海绵涂布器转移到病灶。产品十分方便，病人可以自行使用。虽然温度跟液态氮的温度相距甚远，不过同样有效令病灶死亡。诱发并发症包括令正常皮肤冻伤起水泡。同类产品如Wartner(疣立消)。

*液态笑气(nitrousoxide)，以特细喷嘴把冷冻剂直接喷于病灶上，温度可低至摄氏零下89度。另由于喷射范围小，容易控制，病人可准确告诉医生什么何时整个病灶完成冷冻（病灶本身没有神经线，所以过程不痛，当病人感到疼痛时，代表冷冻位置刚伸展到正常组织）。基于这些优点，治疗一般只要一次就能够完成。同类产品如CryoPen。

激光治疗

通常使用脉冲染料激光或二氧化碳激光。由于红血球细胞会选择性吸收脉冲染料激光（波长582纳米），所以能够达到有效加热。二氧化碳激光则会被水分子性吸收，达到挥发掉组织的水分从而杀死细胞。脉冲染料激光破坏性较小，相对容易不留疤痕。二氧化碳激光破坏组织和皮肤的能力较强。激光治疗很痛，甚至会引起小疤痕。所以最好由有经验医生操作，但治疗昂贵。二氧化碳激光处理可能要施用局部麻醉。脉冲染料激光治疗很多时不需要镇静或局部麻醉，但可能需要2到4次治疗。通常情况下，每隔10至14天一次。