病因未明。多数患者血清中存在抗基底膜带成分的自身抗体,免疫电镜显示这种抗体结合 在基底膜带的透明层，因此本病也为器官特异性自身免疫病。
现将BP循环抗体的靶抗原定位于半桥粒上的大疱性类天疱疮抗原1（BPAgl，又称BP230） 和大疱性类天疱疮抗原2（BPAg2,又称BP180）。BP230为胞质内蛋白，虽然有80% -90%患者 的血清能与其发生反应，但其抗体的被动血清转移实验不能引起BP。BP180为跨膜蛋白，胞内； 部分（氨基端）位于半桥粒的斑块内，胞外部分（梭基端）位于基底膜带内，将抗BP180氨基端的 抗体转移至鼠复制出类似于人BP的动物模型,因此抗BP180抗体是BP的致病性抗体。现已证 实BP患者体内存在针对BP180的自身反应性T细胞，能自发识别BP180o水疱形成的原因可 能是由于基底膜带透明层部位的抗原抗体反应，在补体的参与下趋化白细胞并释放酶。