根据上述临床表现、影像学发现，辅以各种内分泌检查等不难与其他疾病相鉴别。
垂体瘤需和其他鞍区占位的疾病鉴别，医生将从多个方面进行详细检查以判断。
颅咽管瘤：起源于颅咽管的上皮肿瘤，是儿童最常见的鞍区肿瘤之一。患者常表现为发育停滞，1/3患者有尿崩症的表现，影像检查以鞍上蛋壳样钙化及囊性改变为主要特点。
空蝶鞍综合征：常由于先天或后天因素造成蝶鞍内相对空虚，蛛网膜下腔在脑脊液的冲击下突入蝶鞍内可以产生类似垂体腺瘤的特征。CT扫描上很容易鉴别，空蝶鞍CT表现为鞍内低密度且不被增强。
原发性甲减继发垂体增生：原发性甲状腺功能减退可导致垂体增生。表现为甲减的症状，同时甲状腺激素降低、促甲状腺激素（TSH）升高，磁共振成像（MRI）表现为垂体弥漫性增大。该病经甲状腺激素替代治疗后，肿大的垂体可以逐步恢复正常。
