1、胃肠道出血：应与咽下综合征，应激性溃疡，消化道畸形和感染引起的消化道出血鉴别，这些患儿无凝血障碍，咽下综合征是新生儿出生时咽下母亲产道的血液或带血的羊水等，于生后不久即发生呕吐，呕吐物呈棕色，也可有血便，但血量均微，洗胃后可止吐，另外，碱变性试验(Apt试验)有助于鉴别母血及儿血。

2、产伤性出血：多发生于分娩的先露部位，生后即出现，但需注意产伤偶可与本病同时并存，使出血加重。

3、其他：如脐部出血应与脐带接扎不紧，脐部感染或肉芽肿等所致出血鉴别，阴道出血应与“假月经”鉴别，遗传性毛细血管扩张症可在新生儿早期发生消化道出血。