病态窦房结综合征的患者要根据患者的心率情况和发作的情况来应进行药物治疗。如果说心率偏慢，但是没有低于40次/分，也没有明显的长间歇，这种情况可以通过服用心宝丸来提升心率。
如果说患者的心率过慢，或者是患者出现了慢快综合症，这种情况服用药物效果差，必须通过心脏起搏器植入治疗来改善缓慢的心率。
而且对于病态窦房结综合征的病人合并有慢快综合征的话，安装上起搏器之后，还需要应用抗心律失常的药物，因为患者容易合并心房扑动，心房颤动，可以应用β受体阻断剂来控制心室率。如果说是房扑、房颤的病人，还需要加上抗凝药物预防血栓的形成。
