主要依据其临床表现与真菌学检查，一般诊断并不困难。必要时可重复真菌检查。但不典型手足癣常常容易和手足湿疹、掌跖脓疱病及汗疱疹等相混淆，应注意鉴别。  

1、手足湿疹：是一种常见的变态反应性、非传染性、过敏性表皮炎症，由多种内外因素引起的表皮及真皮浅层的炎症性皮肤病，一般认为与变态反应有一定关系。其临床表现具有对称性、渗出性、瘙痒性皮肤病、多形性和复发性等特点。  

2、掌跖脓疱病：是指局限于掌跖部的慢性复发性疾病，以在红斑的基础上出现周期性的无菌性小脓疱，伴角化、鳞屑为临床特征。好发于50～60岁，女性多见于男性。对治疗反应差。  

3、汗疱症：又称为出汗不良性湿疹，为一种手掌、足跖部的水疱性疾病。本病多发生于春末夏初，夏季加重冬天可自愈。多见于青少年。