对常用抗生素大多耐药，可根据临床及细菌学培养与药物敏感试验结果选用抗生素。抗绿脓杆菌抗生素中青霉素族有磺苄青霉素、羧苄青霉素、呋苄青霉素及氧呱嗪青霉素等，第三代头孢菌素则有头孢噻甲羧肟;亦可加用氨基苷类如丁胺卡那霉素、妥布霉素等。  

1.局部治疗：  

可用1%醋酸冲洗或局部，应用多粘菌素B或多粘菌素E，即可奏效，坏死组织必须扩清，而脓肿则必须引流。若需肠外给药治疗，用妥布霉素或庆大霉素5mg/(kg.d)分剂给予，可治愈大多数绿脓杆菌性尿路感染。根据临床反应。可将剂量减少到3mg/(kg.d)以尽量减少副作用。肾功能不全者的剂量必须减少。对酶介导耐妥布霉素和庆大霉素的绿脓杆菌应该用丁胺卡那霉素。  

2.全身治疗：  

对全身性感染或粒细胞缺乏的病人，应该用一种对绿脓杆菌有效的氨基糖苷与一种抗假单胞菌青霉素合用。对嗜中性白细胞减少并且肾功能处于边缘状态的病人，可用非氨基糖苷类联合疗法，例如双重β-内酰胺或β-内酰胺加一种氟喹诺酮，也是安全的。尿路感染常可用羧茚苄青霉素或环丙沙星或其他氟喹诺酮类药物治疗。但氟喹诺酮类不应该用于儿童，因为该药对软骨有不良作用。  

马鼻疽杆菌感染治疗  

原发损害宜尽速行手术切除，并应用磺胺药或链霉素、氯霉素等抗生素。类鼻疽杆菌感染治疗  

四环素、氯霉素、链霉素及磺胺药为敏感的抗生素。