很多药物可引起AIN,以抗生素、磺胺、非甾体类抗炎药、抗惊厥药等最为常见。药物（半抗原）与机体组织蛋白（载体）结合，诱发机体超敏反应（包括细胞及体液免疫反应），导致肾小管间质炎症。某些头弛菌素类抗生素可抑制肾小管上皮细胞内线粒体功能，造成细胞“呼吸窘迫”。由非甾体类抗炎药引起者，同时可导致肾小球微小病变。

光镜检查可见肾间质水肿，弥漫性淋巴细胞及单核细胞浸润,散在嗜酸性粒细胞浸润,并偶见肉芽肿。肾小管上皮细胞呈严重空泡及颗粒变性，刷状缘脱落，管腔扩张。而肾小球及肾血管正常。免疫荧光检查多阴性，由甲氧苯青霉素引起者有时可见IgG及C3沿肾小管基底膜呈 线样沉积。电镜除进一步证实光镜所见外，在非街体类抗炎药引起肾小球微小病变时,还可见肾小球脏层上皮细胞足突广泛融合。