本病是褐黄病色素沉着在关节处所引起，故其并发症主要是由于褐黄病所引起，色素沉积在椎间盘和关节软骨，使软骨变色，弹性减弱，变脆，对压力失去抵抗，且易碎裂，小的破碎软骨片可以脱落进入关节腔内，继而骨质增生,最终发生继发的退行性骨关节病，主要还沉积于透明软骨，纤维软骨，纤维组织和肌腱内，常见于耳廓，鼻，关节软骨，大血管内膜，心肌瓣膜，肾及肺，其次为巩膜，角膜及椎间盘中，男性病患者还常合并黑色前列腺结石。