1、风湿性心脏病和冠心病：在甲亢病人出现心房纤维震颤，心力衰竭时应注意鉴别。

2、恶性肿瘤：淋巴瘤时可有颈部肿块，发热，体重减轻，疲乏无力，恶性肿瘤的病人有体重减轻，腹泻，胃纳减退时应注意鉴别。

3、阿狄森病：有皮肤色素沉着的甲亢可能与阿狄森病混淆，因都有疲乏无力，体重减轻，腹泻，但甲亢时口腔黏膜无色素沉着，甲状腺肿大，甲状腺功能的改变。

4、单侧眼球突出应与眶内肿瘤鉴别，儿童的双侧突眼，应与狭颅症鉴别。