1、烟曲菌：肺曲菌病主要由烟曲菌引起。该菌寄生在上呼吸道，只有在慢性病患者机体免疫力降低时才能致病。
2、吸入曲菌孢子：空气中到处有曲菌孢子，在秋冬和阴雨季节，当储藏的谷草发热霉烂时更多。吸入曲菌孢子不一定致病，大量吸入才能引起急性气管-支气管炎或肺炎。本病常继发于肺部已有疾病，如支气管囊肿、支气管扩张、肺炎、肺脓肿等。曲菌的内毒素使组织坏死，病灶为浸润性、实变、支气管周围炎或粟粒状弥慢性病变。
