1、先天因素：  

前列腺囊肿先天性者发生于中肾管或副中肾管系统的残余部分，囊壁由纤维肌组织构成;后天性囊肿多由于前列腺腺泡不完全梗阻形成潴留性囊肿，腺泡上皮变薄，囊肿壁为由立方上皮覆盖的纤维肌组织，囊液为黏液，可有精子。  

2、内分泌失调：  

起源于苗勒管的融合末端，并被认为和女性的子宫与阴道上部相类同，故被称为男性子宫，另有些作者认为前列腺囊是尿生殖窦背侧壁向背侧伸出形成的一个小袋，它可能是阴道的等同物，该囊扩张形成囊肿可能由两种情况形成：  

(1)由于保留了中肾旁管尾端的部分较多，(如保留到子宫体甚至输卵管部)，故在某些男性假两性畸形有时可见整个中肾旁管结构的保留，  

(2)少数病例前列腺囊肿因受到弱的或暂时的内分泌平衡失调的刺激而扩张，肥大，导致囊肿的形成。