1、消化系统发育尚未成熟，胃酸和消化前分泌少，酶活力偏低。不能适应食物质和量的较大变化。婴幼儿水代谢旺盛，婴儿每日水的交换量为细胞外液量的1/2，而成人仅为1/7，对缺水的耐受力差，一旦失水容易发生体液紊乱。婴儿时期神经调节、内分泌、循环、肝功能、肾功能发育不成熟，容易发生消化道功能紊乱。

2、生长发育快，所需营养物质相对较多，且婴儿食物以液体为主，入量较多，胃肠道负担重。

3、机体防御功能差 ①婴儿胃酸偏低，胃排空较快，对进入胃内的细菌杀灭能力较弱；②血清免疫球蛋白(尤其是IgM IgA)和胃肠道分泌型IgA(SIgA)均较低。肠黏膜的免疫防御反应及口服耐受机制均不完善。

4、肠道菌群失调 正常肠道菌群对入侵的致病微生物有拮抗作用，新生儿生后尚未建立正常肠道菌群、改变饮食使肠道内环境改变。或滥用广谱抗生素，均可使肠道正常菌群平衡失调而患肠道感染。同时，维生素K的合成有赖于肠道正常菌群的参与，故小婴儿肠道菌群失调时除易患腹泻外，还可有呕吐或大使中带血。

5、人工喂养 母乳中含有大量体液因子(SIgA、乳铁蛋白)、巨噬细胞和粒细胞、溶菌酶、溶酶体等，有很强的抗肠道感染作用。家畜乳中虽有某些上述成分，但在加热过程中被破坏。而且人工喂养的食物和食具易受污染，故人工喂养儿肠道感染发生率明显高于母乳喂养儿。