本病主要与内脏蠕虫蚴移行症、海异尖线虫病相鉴别。其次还需要与临床表现同本病类似的其他感染性疾病相鉴别，如：肠系膜淋巴结炎、胆囊炎、胰腺炎、阑尾炎、肠梗阻、溃疡性结肠炎，上述疾病均能引起异尖线吸虫蚴移行症腹部绞痛，故应根据疼痛特点、B超、CT检查进行明确。