1、诊断
根据病史和典型临床表现较易作出诊断，第一鳃裂瘘管伴有耳内流脓，易误诊为化脓性中耳炎，因此应注意二者的鉴别，第二，三，四鳃裂瘘管在胸锁乳突肌前缘中1/3和下1/3交界处，周围有外瘘口，扁桃体窝，梨关窝，食道上端有内瘘口，沿外瘘口向上触诊，可触及有坚实条索状物通向高处，经瘘口行X线碘油造影，可明确诊断。
2、鉴别诊断
根据本病的临床表现应与颈部结核性瘘管、放线菌病性瘘管相鉴别。
(1)颈部结核性瘘管：本病通常有淋巴结结核的感染史，由于结核菌破坏组织，形成冷脓肿，当结核破溃以后瘘管常经久不愈，可进行分泌物的抗酸染色予以区分。
(2)放线菌病性瘘：本病是由于放线菌的感染所致，根据分泌物的检查可以明确区分。
