一、治疗方针：患者应卧床休息，增加营养，纠正水电解质紊乱和缺氧，经鼻或面罩给氧，FiO2(吸入氧浓度)<50%时，动脉血氧分压在70mmHg以上，严重缺氧者则采用辅助通气或体外膜氧。尽量减少免疫抑制剂的应用，但对严重弥漫性病变者，尤其是AIDS患者则应短期使用糖皮质激素，如泼尼松龙。
二、药物治疗
1、病因治疗：磺胺甲恶唑/甲氧苄啶（复方磺胺甲异恶唑）是较为理想的治疗药物，有一定疗效，AIDS病人半数以上可出现药物副反应。
2、喷他脒：对肺孢子菌有致死作用，但副反应发生率可达50%。缺点是毒副反应大，主要为肾毒性。主张常规药物不能耐受和无效时用，仍可取得一定疗效。
3、AIDS患者，应用磺胺甲恶唑/甲氧苄啶或喷他脒疗程要长，为3周或更长。初期疗效同非AIDS患者相似，但药物副作用的发生率和严重性更明显，复发率可高达50%。对TMP-SMAK或喷他脒过敏或治疗失败者，可用下列药物：①氨苯砜加甲氧苄啶（TMP）；②二氟甲基乌氨酸；③克林霉素加伯氨喹。
