舌咽神经痛是指发生在舌咽神经分布区域的阵发性剧烈疼痛。病因不明，可能为神经发生脱髓鞘性变，引起神经传入冲动障碍所致。在继发性病因中，包括桥脑、小脑角的血管异常和肿瘤、珠网膜炎、椎动脉病，以及发生于颈动脉、咽、喉、扁桃体等处的颅外肿瘤。有人认为颅外血管疾患，如颈内动脉闭塞和颈外动脉狭窄等也都可能成为本病的病因。